L'équipe prend en charge un père souffrant d'absences et de pertes de mémoires inexpliquées, voire de somnambulisme. Il élève une jeune fille de 12 ans qui semble avoir les mêmes problèmes que son père... Pendant ce temps, House apprend que Cuddy s'apprête à adopter un bébé. Elle rencontre la mère et remarque des éruptions étranges sur son bras. Son cas s'aggrave et Cuddy est prise dans un cruel dilemme : sauver la mère ou sauver le futur bébé ?

Le Dr House soigne une nonne qui présente des symptômes d'allergie mais manque de la tuer. Pour comprendre ce qui s'est passé, Chase se rend au monastère de la religieuse. Une visite qui, à défaut d'apporter des réponses médicales, ramène Chase à des questions personnelles. Alors que la santé de la nonne se dégrade à chaque fois qu'un nouveau traitement lui est administré, Cuddy décide d'enlever le dossier au Dr House.

Un professeur s'évanouit en classe et crache du sang. Maintenant que Cuddy s'occupe de son enfant, elle demande à Cameron de prendre en charge la gestion de l'hôpital et surtout de surveiller House. En même temps, Foreman doit prendre une décision très importante sur le traitement que doit prendre 13 pour sa maladie.

House prend en charge le cas d'un dealer. La voisine de House et Wilson les croit homosexuels mais chacun d'entre eux tente de la séduire.

Un accident de bus laisse House avec un sérieux trauma crânien et une amnésie partielle. Commençant à croire qu'un patient du bus avait une maladie qui menaçait sa vie, le médecin tente de se souvenir de qui il s'agissait et de quoi il souffrait...

House s'occupe d'un jeune homme de 16 ans victime d'un accident de voiture et qui n'arrête pas de saigner. Le médecin doit trouver une explication à ces saignements continus. Parallèlement, il accepte de relever un challenge lancé par le Dr Cuddy : ne pas prendre de Vicodine pendant une semaine. Mais les symptômes de manque ne tardent pas à apparaître. Pour ne rien arranger, les directives de House concernant Keith se font plus radicales et risquées qu'à l'habitude...

Un riche businessman a entendu parler de la renommée de House et demande à Cuddy que House soigne son fils d'une maladie incurable. House n'ayant pas récupéré sa licence pour exercer, Cuddy lui demande de s'en occuper officieusement pendant que Foreman le surveillera.

A la surprise générale au sein de l'hôpital, Chase a été poignardé par un patient devenu violent et incontrôlable. Le médecin est conduit d'urgence au bloc opératoire. House, Park, Taub et Adams se retrouvent confrontés à Walter Cofield, chef du département de neurologie. Chacun à leur tour, il les interroge sur les symptômes du malade et essaie de déterminer avec eux les causes de cette crise psychotique. Après son opération du coeur, Chase ne sent plus ses jambes. House découvre la présence d'un caillot. Pourra-t-il être éliminé assez tôt pour qu'il conserve l'usage de ses membres inférieurs ? L'enquête se poursuit pour comprendre les raisons de ce drame survenu à l'hôpital...

Treiber, le médecin légiste de l'hôpital, que ses collègues ne portent pas dans leur coeur, se blesse avec son scalpel après une autopsie. Wilson emmène House pour une virée en voiture sur la route de Cleveland. Chase dissimule l'absence de House à Treiber, tandis que Wilson, sous l'identité usurpée de Kyle Calloway, se fait remarquer par ses excentricités. Cependant, Taub et Park font une curieuse découverte dans le laboratoire de Treiber...

Une jeune femme prise de convulsions dans son bain est admise dans le service du docteur House. Son bébé, qui a failli se noyer, est pris en charge en néonatalogie où travaille exceptionnellement Chase. Foreman, qui ne paraît pas avoir de séquelles physiques de la grave maladie qui a failli lui coûter la vie, réintègre le service. Il semble néanmoins avoir beaucoup changé et perdu toute agressivité. House tente de le secouer...

House revient à Princeton où il continue son rétablissement. Il annonce à Cuddy qu'il va y avoir du changement dans sa vie. De son côté, l'équipe n'est pas en mesure de traiter un patient, créateur de jeux vidéo, qui préfère écouter les traitements des internautes plutôt que celui des médecins.

C'est la veille de Thanksgiving: House et l'équipe soignent un patient du nom de James Sidas un physicien et écrivain très brillant devenu coursier. Selon lui, l'intelligence est un fardeau qui a entraîné la toxicomanie, la dépression et bien d'autres symptômes.

Alors que l'équipe médicale s'occupe d'un jeune universitaire âgé de dix-neuf ans, le docteur Foreman donne soudainement sa démission, et ce sans aucune raison, au grand étonnement de tous... House semble avoir déjà trouvé le remplaçant de Foreman, une nutritionniste très attirante prénommée Honey

House et son équipe prennent en charge Frankie, une jeune femme admise en urgence car elle souffre de saignements et voit son corps se couvrir d'ecchymoses. Elle est également une bloggeuse fanatique, qui relate tous les détails de sa vie sur Internet, au grand désespoir de son petit ami, Taylor. Depuis sa chambre d'hôpital, elle publie son état sur son blog et demande à ses fidèles lecteurs de donner leur avis sur le traitement à suivre. Ce comportement amène House et ses collègues à réfléchir à la préservation de la vie privée, d'autant plus que House et Wilson découvrent des secrets les concernant...

L'effervescence règne au sein de l'hôpital «Princeton-Plainsboro», car un nouveau-né vient d'être enlevé dans la nursery de l'établissement. C'est son père qui a remarqué sa disparition et a donné l'alarme. Cuddy ordonne aussitôt la fermeture de l'hôpital, car tout porte à croire que l'enfant et son ravisseur se trouvent encore dans ses murs. Cuddy demande également au personnel de rester enfermé alors qu'elle organise les recherches. House, lui, tente d'esquiver les policiers et se réfugie dans une chambre où se trouve un patient mourant. Au bout d'un moment, il finit par s'intéresser à son sort...